咸平三年，王均在蜀地叛乱，与雷有终、上官正、石普一同受诏进军讨伐，在城西门立营寨。贼军忽然打开城门假装逃走，雷有终等人各率所辖人马直接入城，李继昌发觉，急忙制止，他们没有听从，因而独自返回营寨。贼军果然关闭城门出动伏兵，官军全军覆没，雷有终等人仅仅自身得免于难。李继昌按兵不动，部下将校听到城中作战的声音，哭着请求撤煺。李继昌説:“我的官位最低，应当等候主帅的命令。”当天晚上，雷有终派人快马送来文书，调李继昌驻兵雁桥门。三月，攻克弥牟寨，斩首千级，缴获大批武器，进逼鱼桥门，王均逃走。李继昌入城，严格告诫部下，没有人骚扰百姓。俘获妇女儿童安置在空的寺院中，等事态平稳后放他们回家。李继昌迅速率军追击贼军到资州，听到王均被斩首才返回。

    大中祥符元年，升官级为东上閤门使。不久因眼病请求返回京城。稍稍痊愈，命令枢密院传旨，即将实任爲刺史，再次出任延宏。李继昌因病上表请求退休。不久，改爲右骁卫大将军。其子李遵勗，娶万寿长公主。天禧初年，公主生日，邀请李继昌到家中，迎接礼拜祝寿。皇帝得知此事，偷偷用袭衣、金带、器币、珍奇果品、美味菜肴赏赐他。二年冬，去世，享年七十二岁。

    李继昌性情谨慎敦厚，士大夫乐于同他交往。治理崇尚宽厚，所到之处百姓都怀念他。任峡路时，与上官正共事。上官正残忍好杀,曾经有县吏护送粮草，路远超过期限，上官正下令把他斩首，李继昌慢慢爲他开脱得到宽恕。有郑伸其人，早死，他的母亲贫穷飢饿，曾经到李继昌那里乞讨，家人争着上前辱駡驱赶。李继昌召她相见，给与白银一百两，当时的人都称赞他。